Un nouvel outil de diagnostic développé pour la menace mondiale Xylella fastidiosa augmente la spécificité

La bactérie Xylella fastidiosa se caractérise par une large gamme d'hôtes, capable d'infecter plus de 300 plantes. X. fastidiosa a longtemps causé de graves dommages aux cultures et aux arbres dans les Amériques, avec des répercussions particulièrement néfastes sur la vigne et les agrumes.

En 2013, X. fastidiosa a été découverte pour la première fois en dehors des Amériques, attaquant des oliviers dans le sud de l'Italie, provoquant le syndrome de dépérissement rapide de l'olivier. Depuis lors, il a été trouvé de plus en plus dans divers environnements, en France et en Espagne, sur diverses espèces de plantes et la demande d'outils de diagnostic rapides et fiables est cruciale pour des stratégies de gestion efficaces des maladies.

Dans un article de recherche sur les maladies des plantes , Bonants et al. enregistrer leurs efforts pour améliorer la fiabilité des outils de diagnostic X. fastidiosa existants. L’équipe a combiné deux outils existants avec un contrôle interne pour développer un test Triplex TaqMan, qu’ils ont ensuite utilisé pour analyser des extraits d’ADN dans du matériel végétalnaturellement infecté , du matériel végétal infecté artificiellement et du matériel végétal non infecté.

Le test Triplex TaqMan a augmenté la spécificité puisqu'il cible deux loci plutôt que seulement sur le locus d'un génome de X. fastidiosa . C'est la première fois qu'un outil de diagnostic de ce type a été développé avec succès pour ce pathogène.

En outre, les chercheurs ont mis au point des procédures d'analyse des extraits d'ADN de plantes saines et infectées à l' aide de la technologie de séquençage de prochaine génération (NGS), marquant ainsi la première analyse des extraits de plantes infectées par X. fastidiosa . Dans tous les échantillons, des lectures d'ADN spécifiques à X. fastidiosa ont été détectées et, dans la plupart des cas, l'agent pathogène pouvait être identifié au niveau de la sous-espèce. Cette nouvelle procédure ouvre la voie à de futures études de suivi.

Source: https://phys.org